2004年，国家环境监测总站根据卫星遥感数据和生态环境现状调查数据，从生物丰度、植被覆盖、水网密度、土地退化、污染负荷五个方面，计算出全国各地生态环境质量指数EQI并进行排序，庆元在全国2348个县（市、区）中名列第一，是名副其实的“中国生态环境第一县”。

    庆元山水神秀，自然风光绝美，境内群山环抱，绿水洄流，风光奇丽，加之冬暖夏凉的独特气候，形成了庆元特有的幽雅神秘的生态环境和无与伦比的自然美景。这里山水清丽，林木葱郁，森林覆盖率高达86%，被誉为“浙南林海”；这里水流两省达三江，境内雨量充沛，溪流纵横，水力资源丰富，是瓯江、闽江、赛江“三江之源”。

    国家级自然保护区百山祖，最高峰海拔1856.7米，为江浙第二高峰。在这座原始森林里，除了秀丽的风景，珍稀动植物也是随处可见。有兽、鸟、昆虫及两栖类动物近2000种，种子植物有171科762属1462种，真菌21科230种，占全国种子植物种类的50%以上。全球仅存三株、最濒危的十二种植物之一、国家一级保护植物百山祖冷杉就在保护区内。2000年，发现世界极度濒危的十大物种之一、国家一级保护动物华南虎重现百山祖。百山祖被誊为“天然珍稀动植物园”。

    近年来，庆元县立足生态优势，树立科学的生态观，用经济理念保护生态，用生态理念发展经济，实现生态经济与经济生态的良性互动，大力发展生态产业，促进生态优势的发挥和生态资本的保值增值。加强生态县建设，研究制定生态县建设的政策措施，强化政府对资源开发和环境保护的宏观调控，充分发挥税收、信贷、价格等经济杠杆在防治污染、改善环境中的调控功能。2008年，庆元县通过省级生态县创建验收，80%的乡镇达到省级生态乡镇的目标。

    庆元县立足生态旅游文化的挖掘与培育，结合旅游资源特色，充分发挥“中国生态环境第一县”的品牌效应，结合香菇文化、进士文化、廊桥文化、筷子文化等地方民俗文化，形成了集自然人文于一体的旅游文化体系，丰富旅游产品的文化内涵，塑造了个性鲜明的区域旅游文化形象。着力塑造“中国生态环境第一县”、“中国廊桥之乡”、“中国香菇城”等区域形象,加强“神奇百山祖、梦幻古廊桥、中国香菇城、大济进士村”四大品牌宣传力度。注重旅游线路设计，通过城市景观的建设和整合，推出菇城景观（夜景）游、“菇城一日游”、 生态休闲度假游、乡村风情游等旅游线路。